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  Mesocricetus auratus (Golden hamster) 
  Madurella mycetomatis 
  Mus musculus (Mouse) 
  Monkeypox virus 
  Myxoma virus 
  Malus hupehensis (Chinese crab apple) 
  Malus prunifolia 
  Mortierella verticillata NRRL 6337 
  Marssonina brunnea f. sp. multigermtubi (strain MB_m1) (Marssonina leaf spot fungus) 
  Metarhizium album (strain ARSEF 1941) 
  Moelleriella libera RCEF 2490 
  Megavirus chiliensis 
  Macrophomina phaseolina (strain MS6) (Charcoal rot fungus) 
  Moumouvirus Monve 
  Megavirus courdo7 
  Megavirus courdo11 
  Magnaporthe oryzae (strain Y34) (Rice blast fungus) (Pyricularia oryzae) 
  Magnaporthe oryzae (strain P131) (Rice blast fungus) (Pyricularia oryzae) 
  Murine leukemia virus 
  Moloney murine sarcoma virus (MoMSV) 
  Moloney murine sarcoma virus (strain HT-1) (MoMSV) 
  Moloney murine sarcoma virus (strain m1) (MoMSV) 
  Murine sarcoma virus 3611 
  Myeloproliferative sarcoma virus 
  Myeloproliferative sarcoma virus (isolate ts159) 
  Manoao colensoi (Silver pine) (Dacrydium colensoi) 
  Mucor circinelloides f. circinelloides (strain 1006PhL) (Mucormycosis agent) (Calyptromyces circinelloides) 
  Malassezia sympodialis (strain ATCC 42132) (Atopic eczema-associated yeast) 
  Megavirus lba 
  Moumouvirus goulette 
  Metarhizium brunneum (strain ARSEF 3297) 
  Metarhizium majus (strain ARSEF 297) 
  Meira miltonrushii 
  Metarhizium anisopliae BRIP 53293 
  Maruca vitrata nucleopolyhedrovirus 
  Mougeotia scalaris (Green alga) (Sphaerocarpus scalaris) 
  Melanopsichium pennsylvanicum 4 
  Metzgeria crassipilis 
  Monoraphidium neglectum 
  Malus micromalus (Kaido crab apple) 
  Marchantia polymorpha subsp. ruderalis 
  Magnaporthe grisea (Crabgrass-specific blast fungus) (Pyricularia grisea) 
  Mapania palustris 
  Mycoplasmataceae bacterium RV_VA103A 
  Melia azedarach (Chinaberry tree) 
  Mucuna pruriens (Velvet bean) (Dolichos pruriens) 
  Macrobrachium nipponense (Oriental river shrimp) (Palaemon nipponensis) 
  Metarhizium rileyi 
  Morus alba var. multicaulis 
  Macrothelypteris torresiana 
  Monotropa hypopitys 
  Mycobacterium tuberculosis 
  Methanohalophilus sp. T328-1 
  Methanoregulaceae archaeon PtaB.Bin009 
  Methanoregulaceae archaeon PtaU1.Bin059 
  Methanoregulaceae archaeon PtaU1.Bin066 
  Mesotaenium endlicherianum 
  Micrasterias fimbriata 
  Methanothermobacter thermautotrophicus (strain ATCC 29096 / DSM 1053 / JCM 10044 / NBRC 100330 / Delta H) (Methanobacterium thermoautotrophicum) 
  Methanothermobacter sp. MT-2 
  Methanohalophilus sp. 
  Mammea americana (Mammee apple) (Mammea emarginata) 
  Methanocorpusculum sp. MCE 
  Musa acuminata subsp. malaccensis (Wild banana) (Musa malaccensis) 
  Methanosarcina mazei (Methanosarcina frisia) 
  Methanosarcina thermophila 
  Moniliophthora roreri 
  Myotis davidii (David's myotis) 
  Mycobacterium bovis (strain ATCC BAA-935 / AF2122/97) 
  Magnaporthe oryzae (strain 70-15 / ATCC MYA-4617 / FGSC 8958) (Rice blast fungus) (Pyricularia oryzae) 
  Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) 
  Mycoplasma genitalium (strain ATCC 33530 / G-37 / NCTC 10195) 
  Mycobacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) 
  Myxococcus xanthus (strain DK 1622) 
  Microsorum grossum 
  Methanococcus maripaludis (strain S2 / LL) 
  Mycobacterium leprae (strain TN) 
  Mycoplasma pneumoniae (strain ATCC 29342 / M129) 
  Menyanthes trifoliata (Bogbean) 
  Meyerozyma guilliermondii (strain ATCC 6260 / CBS 566 / DSM 6381 / JCM 1539 / NBRC 10279 / NRRL Y-324) (Yeast) (Candida guilliermondii) 
  Mycoplasma hyosynoviae 
  Micromonas commoda (strain RCC299 / NOUM17 / CCMP2709) (Picoplanktonic green alga) 
  Microcebus murinus (Lesser mouse lemur) (Gray Mouse Lemur) 
  Marchantia polymorpha (Liverwort) (Marchantia aquatica) 
  Methanosphaera stadtmanae (strain ATCC 43021 / DSM 3091 / JCM 11832 / MCB-3) 
  Magnolia grandiflora (Southern magnolia) 
  Myxococcus xanthus 
  Mirabilis jalapa (Garden four-o'clock) 
  Mollugo verticillata (Green carpetweed) 
  Mucor circinelloides (Mucor griseo-roseus) 
  Megaselia scalaris (Humpbacked fly) (Phora scalaris) 
  Marek's disease virus serotype 2 MDV2 
  Momordica charantia (Bitter gourd) (Balsam pear) 
  Medicago sativa subsp. varia (Alfalfa) (Medicago varia) 
  Meleagrid herpesvirus 1 (MeHV-1) (Turkey herpesvirus) 
  Moringa oleifera (Horseradish tree) (Moringa pterygosperma) 
  Malus domestica (Apple) (Pyrus malus) 
  Medicago sativa (Alfalfa) 
  Medicago truncatula (Barrel medic) (Medicago tribuloides) 
  Melissa officinalis (Lemon balm) 
  Maianthemum racemosum (False Solomon's-seal) (Smilacina racemosa) 
  Methanohalophilus portucalensis 
  Manihot esculenta (Cassava) (Jatropha manihot) 
  Methanococcus vannielii (strain ATCC 35089 / DSM 1224 / JCM 13029 / OCM 148 / SB) 
  Myriopteris rufa 
  Mesostigma viride (Green alga) 
  Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25177 / H37Ra) 
  Malassezia globosa (strain ATCC MYA-4612 / CBS 7966) (Dandruff-associated fungus) 
  Medicago truncatula var. longiaculeata 
  Medicago truncatula var. truncatula 
  Musa AAB Group 
  Musa AB Group 
  Monotropa uniflora (Indian pipe) (Monotropa brittonii) 
  Marssonina coronariae 
  Microbacterium sp. 
  Malus zumi 
  Metarhizium anisopliae (Entomophthora anisopliae) 
  Micractinium conductrix 
  Moniliophthora perniciosa (strain FA553 / isolate CP02) (Witches'-broom disease fungus) (Marasmius perniciosus) 
  Micromonas pusilla (strain CCMP1545) (Picoplanktonic green alga) 
  Metarhizium robertsii 
  Microcachrys tetragona 
  Myceliophthora thermophila (strain ATCC 42464 / BCRC 31852 / DSM 1799) (Sporotrichum thermophile) 
  Musa itinerans 
  Mesotaenium braunii 
  Myotis lucifugus (Little brown bat) 
  Mertensia paniculata 
  Methanococcus maripaludis KA1 
  Methanococcus maripaludis OS7 
  Metarhizium acridum (strain CQMa 102) 
  Metarhizium robertsii (strain ARSEF 23 / ATCC MYA-3075) (Metarhizium anisopliae (strain ARSEF 23)) 
  Mycena chlorophos 
  Macrothelypteris oligophlebia var. elegans 
  Marseillevirus marseillevirus (GBM) 
  Medicago tornata 
  Malassezia pachydermatis 
  Microbotryum silenes-dioicae 
  Monosiga brevicollis (Choanoflagellate) 
  Mycobacterium tuberculosis (strain CDC 1551 / Oshkosh) 
  Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) 
  Methanoculleus bourgensis 
  Morus nigra (Black mulberry) 
  Metschnikowia bicuspidata var. bicuspidata NRRL YB-4993 
  Monascus ruber (Mold) 
  Meleagris gallopavo (Wild turkey) 
  Mucor ambiguus 
  Macaca fascicularis (Crab-eating macaque) (Cynomolgus monkey) 
  Macaca mulatta (Rhesus macaque) 
  Mustela putorius furo (European domestic ferret) (Mustela furo) 
  Muntiacus muntjak (Barking deer) (Indian muntjac)